В «СТАЛКЕР 2: Сердце Чернобыля» одним из первых важных решений, с которыми сталкиваются игроки, является объединение с двумя противоборствующими фракциями. Первый — это разрозненный коллектив Сталкеров, проживающий в Залесье, который действует независимо и без официального названия. Второе — это Уорд, дисциплинированное ополчение, стремящееся утвердить большую власть над Зоной и ее жителями. Ваш персонаж, Скиф, невольно оказывается запутавшимся между этими двумя группами, когда он ищет Солдера, человека, который, как он подозревает, предал его Уорду во время предыдущей миссии. И Сталкеры Залиссии, и Уорд, похоже, имеют некоторые сведения о местонахождении Солдера.